MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter phage S1249

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013597	TGG	2	6	3	8	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013597	CGA	2	6	27	32	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013597	TCA	2	6	117	122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013597	AGC	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013597	CA	3	6	169	174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013597	AC	3	6	178	183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013597	AAAAT	2	10	206	215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013597	T	7	7	240	246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013597	CGT	2	6	669	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013597	CACG	2	8	675	682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013597	TCA	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013597	CA	3	6	692	697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013597	GCT	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013597	A	7	7	4307	4313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013597	CTT	2	6	6379	6384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013597	GTTT	2	8	6433	6440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013597	TTA	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013597	A	6	6	10658	10663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013597	A	6	6	16333	16338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013597	T	6	6	16359	16364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013597	AT	3	6	22652	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013597	T	6	6	22688	22693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013597	AT	3	6	22730	22735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013597	CAA	2	6	22737	22742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013597	T	6	6	24222	24227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013597	A	6	6	25330	25335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013597	T	6	6	25480	25485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013597	ATA	2	6	26419	26424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013597	CGAC	2	8	26428	26435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013597	GTATT	2	10	26479	26488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013597	A	8	8	26558	26565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013597	TAA	2	6	26626	26631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013597	AGG	2	6	26650	26655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013597	GCC	2	6	31327	31332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013597	CAT	2	6	31461	31466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013597	C	7	7	31485	31491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_013597	GTT	2	6	31511	31516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013597	TTC	2	6	31527	31532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013597	ATA	2	6	31802	31807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013597	AAAT	2	8	31818	31825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013597	GTAAA	2	10	31836	31845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013597	TAA	2	6	31863	31868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013597	AGG	2	6	31897	31902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013597	TTG	2	6	32576	32581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013597	T	6	6	34314	34319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013597	A	7	7	34386	34392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013597	A	6	6	34404	34409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013597	ATTT	2	8	34413	34420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013597	ATT	2	6	34428	34433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013597	AC	3	6	34435	34440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013597	ATT	2	6	34450	34455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013597	TACTT	2	10	34476	34485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013597	ATTA	2	8	34623	34630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013597	AGT	2	6	34637	34642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013597	TTG	2	6	34665	34670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013597	GA	3	6	34885	34890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013597	AATC	2	8	34927	34934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013597	A	8	8	34941	34948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013597	A	7	7	35016	35022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013597	ATT	2	6	35063	35068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013597	AAAG	2	8	35107	35114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013597	TCA	2	6	35119	35124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013597	GGT	2	6	35239	35244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013597	TCGG	2	8	35303	35310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013597	CGC	2	6	35353	35358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013597	GCC	2	6	35475	35480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013597	GC	3	6	35515	35520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013597	AAG	2	6	35820	35825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013597	TCA	2	6	35894	35899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013597	TTGT	2	8	35949	35956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013597	CCT	2	6	36036	36041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013597	ATG	2	6	36065	36070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013597	T	6	6	36130	36135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013597	TCTT	2	8	36147	36154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013597	GAAAA	2	10	36155	36164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013597	TAAA	2	8	36181	36188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013597	TTTA	2	8	36247	36254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013597	AGG	2	6	36255	36260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013597	ACC	2	6	37048	37053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013597	TGG	2	6	37123	37128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013597	AGG	2	6	37164	37169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013597	AAT	2	6	37173	37178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013597	AGC	2	6	37245	37250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013597	T	6	6	37291	37296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013597	T	7	7	37369	37375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013597	TAATA	2	10	37410	37419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013597	CCTA	2	8	37443	37450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013597	T	7	7	37594	37600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013597	GA	3	6	37638	37643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013597	A	6	6	37651	37656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013597	CCG	2	6	37674	37679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013597	CCAC	2	8	37704	37711	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_013597	TAA	2	6	37726	37731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013597	AAC	2	6	38402	38407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013597	GCG	2	6	38436	38441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013597	TAAC	2	8	38468	38475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013597	CAA	2	6	40849	40854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013597	T	6	6	41015	41020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013597	AACC	2	8	41536	41543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013597	TTA	2	6	41569	41574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013597	A	6	6	41578	41583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013597	ATA	2	6	42620	42625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013597	CAAA	2	8	42729	42736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013597	GAA	2	6	42737	42742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013597	TGG	2	6	43926	43931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013597	CGA	2	6	43950	43955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.